Fassbender tvrdil, že ženy ho chtějí víc, když je slavný, ale tím hůř se mu hledá ta pravá. Taková, která s ním nechce chodit jen proto, že hraje ve filmech. Randil tedy hlavně s herečkami a modelkami, které jsou také slavné. Jeho přítelkyněmi byly třeba Zoë Kravitzová nebo Naomi Campbellová. Nikdy to ale netrvalo dlouho.
„Myslím, že můj nejdelší vztah trval dva roky,“ prohlásila hvězda filmů Hanebný pancharti, Prometheus či 12 let v řetězech.
Herec se teď dal dohromady s kolegyní Aliciou Vikanderovou, s níž natáčel film Light Between Oceans.
Rodák z německého Heidelbergu hraje Vikanderové manžela, takže se měli možnost před kamerou jeden druhému přiblížit doslova tělo na tělo. Už během natáčení mezi nimi přeskočila jiskra a podle štábu po skončení filmování spolu začali žít.
Vikanderová je původně baletka, hrála ve filmech Anna Karenina nebo Královská aféra. Před Fassbenderem učarovala švédskému herci Alexanderu Skarsgårdovi.